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Anwendung der SELDI-TOF-Massenspektrometrie zur Identifizierung neuer Biomarker: Möglichkeiten und Grenzen / Application of SELDI-TOF-mass spectrometry for biomarker identification...

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Bibliographische Detailangaben
Zeitschriftentitel: LaboratoriumsMedizin
Personen und Körperschaften: Kiehntopf, Michael, Siegmund, Robert, Deufel, Thomas
In: LaboratoriumsMedizin, 31, 2007, 3, S. 93-108
Format: E-Article
Sprache: Englisch
veröffentlicht:
Walter de Gruyter GmbH
Schlagwörter:
Biochemistry (medical)
Medical Laboratory Technology
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spelling Kiehntopf, Michael Siegmund, Robert Deufel, Thomas 1439-0477 0342-3026 Walter de Gruyter GmbH Biochemistry (medical) Medical Laboratory Technology Clinical Biochemistry http://dx.doi.org/10.1515/jlm.2007.021 <jats:title>Zusammenfassung</jats:title><jats:p xml:lang="de">Die SELDI-TOF-Massenspektrometrie (MS) ist eine der wichtigsten aktuell verfügbaren Technologien zur Hochdurchsatzanalyse von komplexen Proteinmischungen. In zahlreichen Untersuchungen der letzten Jahre konnte gezeigt werden, dass sich durch die Methode des vergleichenden Proteinprofilings mittels SELDI-TOF-MS neue Wege in der diagnostischen Proteinanalytik und insbesondere in der Identifizierung neuer Biomarker beschreiten lassen. Gleichzeitig haben diese Untersuchungen aber auch die Grenzen der Methode verdeutlicht und die besondere Bedeutung der Standardisierung und Qualitätskontrolle sowohl der präanalytischen und analytischen Einflussfaktoren, als auch der nachfolgenden bioinformatischen Auswertung belegt. So hat sich gezeigt, dass das Studiendesign, die Auswahl entsprechender Kontrollgruppen und die Verwendung besonderer, aus der Analyse von Microarraydaten bekannter, statistischer Methoden eine wesentliche Bedeutung für die Reduktion der Rate falsch-signifikanter Peaks haben. Obwohl eine essentielle Forderung zur Validierung der in Pilotstudien identifizierten potentiellen diagnostischen Peakmuster darin besteht, diese in entsprechend großen prospektiven und multizentrischen Studien zu validieren, mangelt es in einer Vielzahl von Studien gerade daran. Bevor diese Untersuchungen nicht in ausreichendem Maße durchgeführt und an einer größeren Anzahl von Fragestellungen gezeigt werden konnte, dass sich die unter standardisierten Bedingungen erhobenen Proteinprofile auch noch Monate/Jahre später unabhängig vom Untersucher und dem verwendeten Gerät reproduzierbar zur Unterscheidung distinkter Patientenpopulationen verwenden lassen, ist die Translation dieser Technologie in die klinische Routinediagnostik potentiell möglich, aber nicht konkret absehbar.</jats:p> Anwendung der SELDI-TOF-Massenspektrometrie zur Identifizierung neuer Biomarker: Möglichkeiten und Grenzen / Application of SELDI-TOF-mass spectrometry for biomarker identification: potentials and limitations LaboratoriumsMedizin
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